Gradleを実行する時のメモリを調整したい場合、いつでも 
下記に説明されているようなorg.gradle.jvmargsを使えば良い 
とつい最近まで思っていた。 
https://docs.gradle.org/current/userguide/build_environment.html 
しかしこのオプションが有効なのは、上記で説明されている通り 
デーモンとして起動した場合だ。 
デーモンとして起動しない場合は適用されないので注意。 
だから、gradle.propertiesにorg.gradle.daemon=falseと書いておきながら 
org.gradle.jvmargs=...とか書いていても意味がない。
デーモン起動でない場合にメモリなどのJVMパラメータを指定したい場合は 
GRADLE_OPTS, JAVA_OPTSを使うといいらしい。 
(これも上記ドキュメントで説明されているが)
先日、Travis CIでの実行時にのみメモリ調整が必要なケースがあり、上記の違いを理解した。 
なおTravis CIならば、.travis.ymlに例えば
env:
  global:
  - GRADLE_OPTS="-Xmx1024m -Xms256m -XX:MaxPermSize=256m -XX:PermSize=256m"とか書けばいい。
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